Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-22■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-22■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.063e-22■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-22■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-22■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.333e-22■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 28.25□□□□□ -1.099e-11■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 NUMA1-229ENST00000545721 2796 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-12■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 27.4
U2AF2P26368 TP53BP1-212ENST00000476454 2222 ntTSL 210.77□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 TP53BP1-208ENST00000434561 613 ntTSL 310.66□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 TP53BP1-215ENST00000571145 431 ntTSL 35.49□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.441e-11■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 SPOP-217ENST00000510476 773 ntTSL 310.47□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-16■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)21.95■■□□□ 1.12e-16■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.141e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.276e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.756e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.826e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.026e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ZNF529-201ENST00000334116 5238 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ZNF529-203ENST00000585960 535 ntTSL 411.1□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ZNF529-205ENST00000586115 587 ntTSL 410.61□□□□□ -0.716e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ZNF529-204ENST00000585983 582 ntTSL 37.45□□□□□ -1.226e-9■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 33.69□□□□□ -1.823e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 PPP4R1-201ENST00000285124 2917 ntTSL 511.23□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-7■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 PPARGC1A-204ENST00000506055 2627 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.066e-12■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 GDPD5-206ENST00000527820 3211 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.046e-12■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.036e-12■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 GDPD5-205ENST00000527322 1000 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.356e-12■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 DEPDC7-204ENST00000532078 1118 ntTSL 216.72■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 TMEM198-203ENST00000421791 1057 ntTSL 223.78■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 NIP7-205ENST00000563364 436 ntTSL 222.64■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 TMEM198-204ENST00000451952 505 ntTSL 520.55■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 PRMT1-209ENST00000527866 968 ntTSL 218.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 NIP7-206ENST00000565034 639 ntTSL 316.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.741e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 NUDT12-203ENST00000508889 934 ntTSL 22.64□□□□□ -1.991e-8■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-207ENST00000579982 1664 ntTSL 221.78■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-203ENST00000577891 1311 ntTSL 219.06■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-204ENST00000577928 604 ntTSL 212.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-206ENST00000579875 865 ntTSL 311.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-205ENST00000578270 2080 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ABHD3-210ENST00000584464 440 ntTSL 23.58□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 27.3
U2AF2P26368 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.753e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MIA3-206ENST00000467190 553 ntTSL 39.31□□□□□ -0.923e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MIA3-212ENST00000495210 731 ntTSL 59.23□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MIA3-204ENST00000354906 3045 ntTSL 56.5□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.383e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 ATG3-207ENST00000494571 2758 ntTSL 25.06□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.345e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TMPO-205ENST00000546828 564 ntTSL 520.57■□□□□ 0.881e-12■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TMPO-213ENST00000556678 713 ntTSL 57.66□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TMPO-206ENST00000547214 721 ntTSL 21.68□□□□□ -2.141e-12■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 PTPRK-215ENST00000498284 524 ntTSL 52.6□□□□□ -1.998e-7■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.514e-9■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 519.63■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 ADAM9-201ENST00000379917 3836 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 ADAM9-204ENST00000468065 3755 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 ADAM9-207ENST00000481873 3793 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.832e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 02e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.57□□□□□ -21e-7■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 27.2
U2AF2P26368 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 27.2
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 397 ms