Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTNP21246 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTNP21246 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTNP21246 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTNP21246 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTNP21246 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTNP21246 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTNP21246 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTNP21246 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTNP21246 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTNP21246 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTNP21246 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTNP21246 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms