Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lama1P19137 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lama1P19137 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lama1P19137 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms