Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spi1P17433 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spi1P17433 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms