Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4AO75164 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4AO75164 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms