Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp4O70480 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vamp4O70480 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp4O70480 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms