Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 IMPA2-203ENST00000586230 563 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 416.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-207ENST00000570756 2426 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 515.65■□□□□ 0.11e-16■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 214.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 COTL1-202ENST00000561707 781 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 213.95□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 27.9
DKC1O60832 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 413.57□□□□□ -0.241e-16■■■■■ 27.9
DKC1O60832 GRIPAP1-203ENST00000474512 904 ntTSL 213.57□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.276e-9■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 413.13□□□□□ -0.311e-16■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-213ENST00000547772 584 ntTSL 212.97□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-225ENST00000570513 553 ntTSL 412.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 212.74□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 412.48□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 AC104123.1-201ENST00000502645 473 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-211ENST00000512659 822 ntTSL 512.13□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 GRIPAP1-202ENST00000473581 3278 ntTSL 212.08□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 412.04□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-207ENST00000532201 597 ntTSL 412.03□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-228ENST00000576582 575 ntTSL 511.97□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-214ENST00000509415 558 ntTSL 411.9□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-206ENST00000503463 750 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TYW1-206ENST00000495971 1302 ntTSL 211.88□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-213ENST00000573166 4236 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TRIM10-203ENST00000376704 3007 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-227ENST00000575560 540 ntTSL 511.13□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-204ENST00000503130 786 ntTSL 311.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 27.9
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DKC1O60832 PXN-216ENST00000550205 547 ntTSL 410.88□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 410.86□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-203ENST00000502590 697 ntTSL 510.69□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LIN7A-201ENST00000261203 989 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-208ENST00000508511 1909 ntTSL 210.25□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TYW1-202ENST00000361660 3255 ntTSL 1 (best)10.1□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 PXN-218ENST00000551327 588 ntTSL 49.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-205ENST00000502761 724 ntTSL 29.76□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LRRC8D-203ENST00000414841 666 ntTSL 39.14□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 38.88□□□□□ -0.992e-27■■■■■ 27.9
DKC1O60832 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 TMEM206-202ENST00000467822 742 ntTSL 38.72□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-221ENST00000513119 973 ntTSL 58.22□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 27.65□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 LIN7A-202ENST00000549417 905 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 46.48□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 27.9
DKC1O60832 YLPM1-209ENST00000554107 4424 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 27.9
DKC1O60832 CALCOCO2-207ENST00000505071 495 ntTSL 55.73□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 27.9
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