Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad7O35253 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad7O35253 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad7O35253 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms