Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac1O09106 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms