Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN3O00409 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN3O00409 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms