Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbip1J3QMK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bbip1J3QMK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms