Protein–RNA interactions for Protein: J3QK25

G530012D18Rik, RIKEN cDNA G530012D1 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G530012D18RikJ3QK25 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
G530012D18RikJ3QK25 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms