Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx7F8VPJ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx7F8VPJ6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx7F8VPJ6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rfx7F8VPJ6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rfx7F8VPJ6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms