Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdh18E9Q9Q6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms