Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn2r35E9Q7U8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms