Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPIPA5E9PKD4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NPIPA5E9PKD4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms