Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp42B2RQC2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp42B2RQC2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp42B2RQC2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms