Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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