Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Knop1Q9Z2Q2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Knop1Q9Z2Q2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms