Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trpv2Q9WTR1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms