Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCN11AQ9UI33 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms