Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Plod3Q9R0E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plod3Q9R0E1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms