Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsfQ9R013 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsfQ9R013 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsfQ9R013 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsfQ9R013 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsfQ9R013 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsfQ9R013 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms