Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC4BQ9NT99 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms