Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Col5a3Q9JLI2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col5a3Q9JLI2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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