Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Extl1Q9JKV7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Extl1Q9JKV7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms