Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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