Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bco1Q9JJS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Bco1Q9JJS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Bco1Q9JJS6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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