Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl28Q9JIL2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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