Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ergic1Q9DC16 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms