Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prkrip1Q9CWV6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms