Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znhit3Q9CQK1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms