Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI3

Gmfb, Glia maturation factor beta, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmfbQ9CQI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GmfbQ9CQI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GmfbQ9CQI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms