Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnf17Q99MV7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnf17Q99MV7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms