Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOQ99835 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMOQ99835 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMOQ99835 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOQ99835 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOQ99835 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOQ99835 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms