Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWNKQ96RR1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWNKQ96RR1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms