Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E2Q96LR5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms