Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk4Q8VEJ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk4Q8VEJ3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms