Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx1Q8C8B0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Alx1Q8C8B0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms