Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc30Q8BVF4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc30Q8BVF4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms