Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grik4Q8BMF5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms