Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rtl1Q7M732 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rtl1Q7M732 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rtl1Q7M732 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms