Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptx4Q6RUU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms