Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9aQ68FE2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg9aQ68FE2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms