Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp9cQ66X01 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp9cQ66X01 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms