Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb6Q60692 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb6Q60692 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms