Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC181Q5TID7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms