Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C2cd3Q52KB6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C2cd3Q52KB6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms