Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C87499Q3UX49 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms