Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srsf6Q3TWW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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